msi9811 님의 블로그

bitr이 무엇이냐?bitr(geneID, fromType, toType, OrgDb, drop = TRUE) 기본 문법은 위와 같다. 유전자의 이름은 형식에 따라 다양한 이름을 가진다. 예를 들어 'CD34' 유전자는 아래와 같다.HGNC: 1662NCBI Gene: 947Ensembl: ENSG00000174059사용자의 목적이나 분석툴의 요구사항에 따라 유전자의 이름을 형식에 맞게 고쳐주어야 하는데 이럴때 유용하게 사용할 수 있는 clusterProfiler 패키지의 함수다. 예시 코드는 다음과 같다.bitr(c('CD33','CD34'), fromType = 'ALIAS', toType = 'ENTREZID', OrgDb=org.Hs.eg.db)#결과 ALIAS ENTRE..

방문일 25/05/05 난이도★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ☆ ☆ 자물쇠:장치★ ★ ★ ★ ★ ★ ☆ ☆ ☆ ☆ (확실치 않음) 공포★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ☆ ☆ ☆ 추천도★ ★ ★ ★ ★ ★ ☆ ☆ ☆ ☆ 탈출 여부실패 (약 70% 진행?) 스토리한마음 폐공장에서 일어난 여러가지 사건을 조사하는 경찰이 되어보자 리뷰처음 입장까진 분위기 좋다. 폐공장 건물로 들어갈때 부터 분위기가 음산해짐. 이 날 다른 테마도 연방을 했는데 이 방탈출 카페의 특징인지 문제를 고민할 시간이 없었다. 그만큼 문제 수가 많고 시간이 말도 안되게 부족하다. 문제푸는 걸 좋아하는 내 입장에선 나랑 잘 안맞음. 여기가 마지막일 줄 알았는데 열고보니 방이 더 있는 걸 알았을때의 절망감이란...

방문일 25/05/05 난이도★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ☆ ☆ ☆ 자물쇠:장치★ ★ ★ ★ ★ ☆ ☆ ☆ ☆ ☆ (확실치 않음) 공포★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ☆ ☆ 추천도★ ★ ★ ★ ★ ★ ☆ ☆ ☆ ☆ 탈출 여부성공 스토리폐가탐험 동아리?의 신입생인 우리는 폐가에 가서 귀신을 부르는 주문을 시작하면서 뭔가가 잘못되는데... 리뷰방탈출을 다니면서 다녔던 방탈출 리뷰해보면 좋을 것 같아서 가장 최근에 간 것 부터 리뷰를 해보려고 한다. 최근 들어 다시 방탈출을 시작했는데 이때까지 가본 방탈출 중 인테리어나 연출이 아주 좋았던 방탈출이였다. 이 날 다른 테마도 연방을 했는데 이 방탈출 카페의 특징인지 문제를 고민할 시간이 없었다. 그만큼 문제 수가 많고 시간이 말도 안되게 부족하다. 문제푸는 걸 좋아..

나는 항상 이 torch.FloatTensor를 다음 코드와 같이 특정 배열이나 리스트를 tensor로 바꾸어주기 위해 사용해왔다.torch.Tensor([1,2,3])#-> tensor([ 1., 2., 3. ])torch.IntTensor([1,2,3])#-> tensor([1, 2, 3], dtype=torch.int32) 하지만 이를 리스트 배열이 아닌 하나만 존재하는 자연수 값이나 set의 경우에는 다음과 같이 해당 숫자만큼의 길이와 랜덤한 원소를 가지는 배열을 뱉어낸다.torch.Tensor(3)->tensor([0.0004, 0.0000, 0.0000])torch.Tensor((3))->tensor([0.0004, 0.0000, 0.0000]) 나의 목적과 다른 결과를 도출하는데 이를 해결하..

다음과 같이 lefse를 돌리는 코드에서buf 아래와 같은 오류가 발생했다.Error in check_rank_names(ps) : ranks of taxonimic profile must be one of Kingdom, Phylum, Class, Order, Family, Genus, Species 이 이유는 다음과 같았다. TAX매트리스의 colname중 'Full'이라는 다른 컬럼이 존재해서였다.rank_names(buf)->#[1] "Full" "Kingdom" "Phylum" "Class" "Order" "Family" "Genus" "Species" 따라서 이를 제거하고 순수하게 Kingdom, Phylum, Class, Order, Family, Genus, Sp..

R에 존재하는 microbiomeMarker package는 다양한 microbiome 분석에 이용할 수 있는 종합 툴로써 많이 사용됩니다.이 package는 설치할 때, 다음과 같이 설치한다.BiocManager::install('microbiomeMarker') 하지만 설치하려고 시도하니 다음과 같은 오류를 만났다.Installing package(s) 'microbiomeMarker'Installation paths not writeable, unable to update packages path: /usr/lib/R/library packages: lattice, mgcv, spatialWarning message:package ‘microbiomeMarker’ is not availab..